申请子系统负责接收和处理特殊药品审批申请。用户可以通过该子系统填写并提交特殊药品申请表格，系统将根据申请表格中进行初步审核，并生成审批流程。

许可证子系统负责管理特殊药品许可证。在特殊药品申请通过审批后，系统将自动生成相应许可证，并提供许可证管理能，包括许可证发放、续签和撤销等。

统计报表子系统负责生成特殊药品审批管理系统各类统计报表。用户可以通过该子系统查询和生成特殊药品统计数据，并按需导出为Excel或PDF格式报表。这些报表可以为管理者提供决策参考，也可以用于与上级机构报告和交流。